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荧光染料,由于灵敏度高,操作方便,逐渐取代了放射性同位素作为检测标记,其广泛应用于荧光免疫,荧光探针,细胞染色等。包括特异性的DNA染色,用于染色体分析、细胞周期、细胞凋亡等相关研究。另有很多核酸染料在多色染色系统中是非常有用的复染剂,可作为背景对照,标记细胞核使细胞内结构的空间关系一目了然。 核酸荧光染料对细胞核染色后定量测量细胞所发出的荧光强度,就可以确定细胞核中DNA、RNA的含量,并可以对细胞周期和细胞的增殖状况进行分析。有多种荧光染料可以对细胞中的DNA或RNA染色,常用的DNA染料包括碘化丙啶(PI)、DAPI、Hoechst 33342等,RNA染料有噻唑橙、吖啶橙等。
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细胞渗透性核染料可用于标记具有健康完整细胞膜的活细胞,以及具有受损膜的细胞(如死细胞,固定细胞或透化细胞)。这些染料的总体毒性相对较低,对细胞功能的影响极小,从而可以在细胞发育和细胞过程(如有丝*和有丝*)的阶段跟踪活细胞,或作为活细胞中合适的复染剂。细胞渗透性核染料包括Hoechst系列染料,Nuclear Violet LCS1,Nuclear Green LCS1,Nuclear Orange LCS1和Nuclear Red LCS1 / LCS2。
细胞不可渗透的核染料可用于受损的质膜标记细胞核,例如死细胞,固定细胞或透化细胞。 由于不渗透细胞的核酸染料不能标记活细胞,因此它们通常在细胞生存力测定中用作死细胞指示剂,或在免疫标记应用中用作核复染。 不渗透细胞的核酸染料包括DAPI,碘化丙啶(PI),7-氨基放线菌素D(7-AAD),Nuclear Blue DCS1,Nuclear Green DCS1,Nuclear Orange DCS1和Nuclear Red DCS1。