DNA测序仪的注意事项

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1.abi prism 310基因分析仪是高档精密仪器,需专人操作、管理和维护。
2.本实验测序pcr反应的总体积是5μl,而且未加矿物油覆盖,所以pcr管盖的密封性很重要,除加完试剂后盖紧pcr管盖外,最好选用pe公司的pcr管。如pcr结束后pcr液小于4~4.5μl,则此pcr反应可能失败,不必进行纯化和上样。
3.作为测序用户来说,只需提供纯化好的dna样品和引物,一个测序pcr反应使用的模板不同,需要的dna量也就不同,pcr测序所需模板的量较少,一般pcr产物需30~90ng,单链dna需50~100ng,双链dna需200~500ng,dna的纯度一般是a260nm/a280nm为 1.6~2.0,最好用去离子水或三蒸水溶解dna,不用te缓冲液溶解。引物用去离子水或三蒸水配成3.2pmol/μl较好。
4.本实验使用的测序试剂盒是bigdye荧光标记终止底物循环测序试剂盒,一般可测dna长度为650bp左右。本仪器dna测序精确度为 (98.5±0.5) %,仪器不能辨读的碱基n<2%,所需测定的长度超过了650bp,则需设计另外的引物。为保证测序更为准确,可设计反向引物对同一模板进行测序,相互印证。对于n碱基可进行人工核对,有时可以辨读出来。为提高测序的精确度,根据星号提示位置,可人工分析该处彩色图谱,对该处碱基作进一步核对

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为了保证DNA测序仪实验的正常进行,DNA测序仪在使用过程中要注意一些容易出现的问题,下面小编带大家了解一下DNA测序仪的注意事项。
1.注意样品的纯度。PCR具有短时间内高效的扩增能力,因此样品的纯度对DNA测序仪反应有至关重要的影响。当样品不纯的时候,那些杂质会对实验结果产生干扰。这在PCR产物测序中表现的尤为明显,在测序结果上表现为峰图杂乱,过多的不可识别的碱基;
2.注意样品的量。尽管DNA测序反应可以高效的扩增待测得模板,使得测序所需要的模板量大大降低,但是当最低限度的模板量也不能提供的话,会引起测序反应的异常,表现为无反应,峰图弱,或者反应中断等;
3.注意样品的形式。这里专指纯化的PCR产物和质粒样品。正常情况下,溶解样品时常用的溶液有以下几种形式:水,Tris溶液,TE(Tris—EDTA)三种。当采用TE为溶剂的时候由于溶液中的EDTA可以干扰测序反应的进行,因此实验人员在进行测序时需要注意样品的溶解方式;
4.注意样品的形式:从DNA测序角度来讲最好是由实验者提供菌液的形式,由公司来提取质粒,这样可以保证DNA样品的数量和质量。如果实验者提供的是质粒或者是纯化后的PCR产物,则需要说明其浓度和溶解的方式;
5.注意PCR产物。若是PCR产物进行测序时,需要实验者同时提供PCR的双向引物各10ul(浓度>5uM/ul),这是因为PCR的引物要求与测序的引物有所不同,因此不能保证一条PCR引物就能够测成功。双向引物可以在一条引物无法测序的情况下,改用另一端的引物测序。(已纯化)浓度>50ng/μl、体积>10μl;(未纯化)浓度>100ng/μl、体积>30μl;引物要求:浓度>5uM、体积>10μl;
6.质粒产物。需要提供明确的质粒名称,大小、浓度以及测序所用的引物名称,如果是自带引物测序(条件同PCR测序),最好也能够标明反应的条件。质粒的大小对于测序也有着一定的影响。样品中,质粒的总量不低于5ug;
7.菌液。需要明确的标明所用的抗生素类型和培养条件,以便样品能够培养和扩增。
综上,关于DNA测序仪注意事项的内容就是这些了,大家在使用DNA测序仪进行实验时,要注意以上几点事项,一定没有问题的。

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