员工不愿意签订劳动合同的，用人单位按以下方式处理：
1、用人单位可以要求劳动者签订劳动合同，签订劳动合同，对用人单位和劳动者都是保障;
2、如果经用人单位要求后，劳动者也不愿意签订的，用人单位可以解除劳动关系，否则用人单位就要承担责任。
劳动合同是指劳动者与用人单位之间确立劳动关系，明确双方权利和义务的协议。用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
用人单位不签劳动合同有以下处罚：
自用工之日起超过一个月未签，向劳动者每月支付二倍的工资；自用工之日起超过一年未签，视为签订无固定期限劳动合同，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。
【本文所涉及的法律依据】：：
《中华人民共和国劳动合同法》
第三条
订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。
依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。
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