临时辞职老板扣工资不合法，具体的原因如下：
1、法律规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠劳动者工资，如果克扣工资，可以通过以下方式解决：
（1）向当地劳动保障监察机构投诉举报；
（2）向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要在劳动争议发生之日起60日内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请：
（3）通过诉讼途径解决，针对劳动纠纷案件，经劳动仲裁后任何一方不服的，可以向法院提起诉讼，经仲裁后都服从，劳动仲裁裁决生效后，用人单位不执行的，可申请法院强制执行；
2、各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付员工工资的情况；
3、如果公司有侵害劳动者权益，可以要求其支付劳动者工资和经济补偿。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》第九十一条
用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。
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